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安捷倫科技針對新一代測序的定制靶向序列捕獲試劑盒序列范圍擴展5 倍，堿基覆蓋可高

發(fā)布時間： 2011-06-01　　點擊次數(shù)： 3149次

安捷倫科技針對新一代測序的定制靶向序列捕獲試劑盒序列范圍擴展5 倍，堿基覆蓋可高達34 Mb

2011 年4 月12 日，北京
    安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日宣布推出用于新一代測序（NGS） SureSelect XT靶向序列捕獲系統(tǒng)的定制試劑盒，該試劑盒可捕獲高達34 Mb 的目標基因組區(qū)域。

    新版定制試劑盒的序列覆蓋范圍比舊版擴展了5 倍，這使得研究人員能夠?qū)⒀芯糠秶鷱娜祟愅怙@子擴展到對動物、微生物、植物及其它生物體中較大的目標區(qū)域進行測序，目前尚沒有針對此類研究的商業(yè)化預定義或目錄版的靶向序列捕獲試劑盒。

    現(xiàn)在研究人員可以利用目錄試劑盒或定制試劑盒對高達34 Mb 的序列進行研究，這種撒大網(wǎng)的方式有利于發(fā)現(xiàn)SNP、插入/缺失以及拷貝數(shù)變異。然后他們可以設(shè)計有針對性的自定義序列捕獲文庫，用于后續(xù)的大量樣品研究。安捷倫提供eArray在線靶向序列捕獲和芯片設(shè)計工具，可幫助用戶設(shè)計并訂購 SureSelect XT 定制版靶向序列捕獲試劑盒（可選 10 到5000 次反應(yīng)，及適用于各種主流 NGS 平臺的格式）。

    安捷倫SureSelect 平臺市場總監(jiān)Fred P. Ernani 博士說：“安捷倫在定制長鏈寡核苷酸制造方面的出眾能力再加上eArray 設(shè)計工具的強大功能，能夠為研究人員帶來的具有高度靈活性且可定制的NGS 靶向序列捕獲系統(tǒng)。現(xiàn)在，安捷倫能夠為研究人員提供 200 Kb 到34 Mb 的大范圍定制捕獲試劑盒，幾乎適用于任何規(guī)模的研究。”

    隨著測序結(jié)果的不斷產(chǎn)生，研究人員可以不斷采用 SureSelect 和eArray 工具反復進行快速設(shè)計和完善。現(xiàn)在，SureSelect XT 用戶擁有全面的文庫設(shè)計選擇，從可直接使用的目錄版試劑盒到結(jié)合了目錄版和定制版內(nèi)容的復合設(shè)計試劑盒，再到*定制設(shè)計的試劑盒。

    擁有DNA 靶向序列捕獲和RNA 靶向序列捕獲的SureSelect XT 產(chǎn)品線成為應(yīng)用范圍zui廣的新一代靶向測序技術(shù)平臺。定制試劑盒的不斷發(fā)展使得早期使用的客戶能夠捕獲超過60 Mb 的序列。

靶向序列捕獲工作流程

    靶向序列捕獲使研究人員可以僅對目標基因組區(qū)域（而非整個基因組）進行測序，從而簡化NGS工作流程。結(jié)合的新一代測序系統(tǒng)的更高速度，SureSelect XT的多重檢測支持功能使得研究人員在每次實驗中都能更全面地認識更多樣品的基因組，這在過去是難以實現(xiàn)的。文庫制備和靶向序列捕獲流程的瓶頸已經(jīng)得到有效解決。

    為進一步提高處理通量，安捷倫還提供了集成式工作站，用于自動化完成SureSelect XT文庫制備和靶向序列捕獲工作流程。可針對多重測序?qū)悠愤M行索引，且所有試劑都適合自動化操作。不久之后，安捷倫的Bravo 自動化液體處理系統(tǒng)所支持的自動化方案將增加RNA 捕獲自動化統(tǒng)包方案。

    SureSelect 靶向序列捕獲平臺作為基因發(fā)現(xiàn)的核心工具，現(xiàn)已被50 多篇同行評審的論文所引用。《科學》雜志12 月17 日刊登的2010 年科學突破中，其中兩項突破“Reading the Neandertal Genome”（解讀尼安德特人基因組）和“Homing In on Errant Genes”（外顯子組測序/罕見疾病基因）均采用了本系統(tǒng)。

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